安徽中药科技学校是一所市属公办医药卫生类中等职业学校,与安徽亳州技师学院实行一校两牌。安徽中药科技学校前身是亳县城关初中，始建于1960年5月；1970年3月至1978年5月停办；1978年6月恢复亳县城关初中；1982年2月更名为亳县四中（亳州四中）；1986年6月改制为亳州市第二高级职业中学；2007年6月更名为亳州中药科技学校；
2011年9月整体搬迁至新校区；2012年4月设立安徽亳州技师学院；2017年7月亳州中药科技学校获批为安徽中药科技学校；2023年9月设立安徽卫生健康职业学院康复专业学院和亳州职业技术学院医药专业学院两个高职专业学院。
安徽中药科技学校目前总建筑面积143995.8平方米，拥有教学仪器设备总值4558.44万元，图书馆图书52.286万册、师生图书阅览室5个。学校设立药学系、医护系、智能工程系，职教高考部、校企合作部、艺术部六个教学系部及中草药种植和研发中心。
安徽中药科技学校开设中药、中药制药、药剂、药品食品检验、护理、康复技术、医学检验技术、医学影像技术、智能网联汽车技术、数控技术应用、机械加工技术等32个专业，其中国家示范校重点建设专业4个、省级示范专业3个。
设有药学实训中心、护理实训中心、数控加工中心等校内专业实训室95个，其中省级示范实训基地3个。学校现拥有产业学院5个、校外实习实训基地78个（其中省级校企合作示范基地3个）。设立黑龙江中医药大学本科教学点和亳州市职业能力等级评价机构。